Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG1Q96JA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms