Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC12Q96J65 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms