Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHDQ96IW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHDQ96IW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHDQ96IW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms