Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms