Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTV1Q96GA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms