Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNFT2Q96EX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms