Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP36Q96EU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms