Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23CQ96ET8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms