Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRRFQ96E11 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRRFQ96E11 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRRFQ96E11 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms