Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4CQ96DT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4CQ96DT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms