Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP27Q96DN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms