Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD4Q96DM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms