Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms