Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC58Q96CX6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC58Q96CX6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC58Q96CX6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms