Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC7A6OSQ96CW6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC7A6OSQ96CW6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.2 ms