Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3DQ96BQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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