Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD1Q969G9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD1Q969G9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD1Q969G9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD1Q969G9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms