Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX4Q969G2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX4Q969G2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms