Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CUL5Q93034 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL5Q93034 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms