Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PRG4Q92954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRG4Q92954 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms