Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD50Q92878 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms