Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB13Q92826 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB13Q92826 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms