Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN4Q92575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms