Protein–RNA interactions for Protein: Q92552

MRPS27, 28S ribosomal protein S27, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS27Q92552 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MRPS27Q92552 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS27Q92552 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS27Q92552 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms