Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOMQ8WWX9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOMQ8WWX9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms