Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCFD1Q8WVM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCFD1Q8WVM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms