Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC7Q8WUI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC7Q8WUI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms