Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG1Q8WTW3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG1Q8WTW3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms