Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIPC3Q8TF64 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms