Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3BQ8TF42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBASH3BQ8TF42 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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