Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF2Q8TEC5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF2Q8TEC5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms