Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MGARPQ8TDB4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms