Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC4Q8TBB5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms