Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APPL2Q8NEU8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms