Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCPH1Q8NEM0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms