Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN4CLQ8ND94 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN4CLQ8ND94 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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