Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms