Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3Q8N5Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSL3Q8N5Y2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms