Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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