Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC43Q8N309 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC43Q8N309 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC43Q8N309 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms