Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VWDEQ8N2E2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms