Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms