Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGDCC3Q8IVU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC3Q8IVU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms