Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIX1LQ8IVB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIX1LQ8IVB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIX1LQ8IVB5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIX1LQ8IVB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIX1LQ8IVB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms