Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNJLQ8IV13 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNJLQ8IV13 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNJLQ8IV13 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms