Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VPS37DQ86XT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37DQ86XT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms