Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD3Q86UT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD3Q86UT5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms