Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC3Q7Z5M5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC3Q7Z5M5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms