Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX9Q7RTT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms