Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTF1AQ7RTS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms